Dalam pelaksanaan kegiatan akademika di lingkup universitas Trunojoyo, Fakultas Pertanian memiliki Visi serta Misi yang diemban dalam perjalanan fakultas ini,
Visi
Pada tahun 2030 menjadi Fakultas yang mampu mewujudkan lulusan yang cerdas, berdaya saing, berakhlakul karimah dan unggul dalam pendidikan bidang pertanian, kelautan dan perikanan, serta riset berdasarkan potensi Madura.
Misi
Untuk mencapai visi yang telah ditetapkan, Fakultas Pertanian UTM menetapkan misi sebagai berikut: